目前科學界的一種普遍觀點是，甲型H1N1流感病毒的變種，與北美地區工業規模化的養豬場的生態環境難脫干系。一些科學家稱，此次致病的病毒存有1987年印地安那州養豬場中發現病毒的基因元素。
養豬設備廠為了保持欄內的清潔衛生，改善環境條件，減少人工清掃，普遍采用糞尿溝上敷設漏縫地板。
對于這種密集的工業規模化養殖方式可能會滋生出新型病毒，也得到了一些科學支持。最近，一項由皮尤慈善信托基金和約翰霍普金斯大學彭博公共衛生學院聯合進行的研究發現，這種工廠化養殖可能會增加新型病毒傳播的風險，其中就包括豬流感和禽流感.
但是養豬設備的先進，使得豬場對排污進行固液分離—厭氧處理—沼氣的系統處理，污水幾乎達到零排放，蚊蠅等失去滋生的條件，豬舍沒有一般豬場那種難聞氣味，也沒有蒼蠅成群的景象。豬場內高架產床、定位欄、漏縫地板、自動食槽、自動飲水器，網上保育設施以及先進的保溫、通風設施等先進的養豬設備俱全。科學合理的豬舍構造保障豬群的健康.
